ChIP-seq（染色质免疫共沉淀测序）根据是否甲醛铰链可以分成N-ChIP（native chromatin immunoprecipitation）和X-ChIP（crosslinking chromatin immunoprecipitation）。之后为了增加peak的分辨率，对ChIP的富集DNA片段进行酶切后建库衍生出了ChIP-exo（exonuclease digestion）。ChIP-seq实验流程包括染色质打算（酶法，超声法），抗体富集，纯化，建库测序。ChIP的两个关键实验细节：1.抗体的选择，一般选择对应物种的ChIP级别，没有的可以考虑IP级别，但是WB的级别风险还是蛮大的。2.DNA打断片段范围。一般打断到200bp-1000bp，这个需要优化酶的浓度和消化时间或者根据超声仪的功率选择合适的超声时间。

欢迎各位老师联系宸谱生物送样进行ChIP-seq，只需要老师将要做的细胞系或者黄豆粒大小的组织直接-80℃保存，干冰运输即可（无需甲醛交联固定）。ChIP中的核心原料采用进口试剂和优化的缓冲液体系，呈现出富集峰最高的信噪比。

[1] Zentner G E , Henikoff S . High-resolution digital profiling of the epigenome[J]. Nature Reviews Genetics, 2014.

[2] Park P J . ChIP–seq: advantages and challenges of a maturing technology[J]. NATURE REVIEWS GENETICS, 2009.

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