snATAC-seq目前也比较成熟了，snATAC-seq和snRNA-seq一样能做冷冻组织，也能避免解离过程的细胞群偏好和应激反应。并且两者在细胞群的类型上匹配性很高。并且可以通过生信的方法进行群映射。如果经费允许的话还是建议每个样本同时做snATAC-seq和snRNA-seq。如果经费首选那需要考虑需求来进行选择：如果课题方向偏向于细胞分群和marker基因鉴定建议选择snRNA-seq，如果课题偏向转录调控机制问题建议选择snATAC-seq。目前做snATAC方法有三种：1.最早的基于programmable microfluidics platform(Fluidigm)2.基于split思想的combinatorial indexing 3.10X Genomics商业平台。基于Fluidigm平台的成本太高，这个方法不建议去做。combinatorial indexing snATAC-seq成本上比较低，不需要购买额外的仪器，在单细胞比较强的实验室还是比较盛行的，但是并不太适合商业服务。论稳定性还是要属10X Genomics平台，缺点就是需要购买仪器，试剂贵。

宸谱生物具有优秀的组织处理能力，在冷冻样本的提核纯核做了大量的优化实验，平台是10X Genomics平台。欢迎各位老师联系我们进行合作。

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