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冷冻组织纯核

最近比较火热的单细胞核snRNA-seq,单细胞核ATAC-seq,常规bulk ATAC-seq,还有其他各种表观测序技术都需要抽核,纯核。可以毫不夸张的说抽核水平的在一定程度上可以体现一个实验平台的表观技术水平。目前文献报道各种各种的抽核方法,不同样本对应的buffer都不一样,都是需要去测试,另外还需要去过流式进行去碎片。最值得参考的是Aviv Regev教授为了做单细胞核测序测试了各种样本,各种buffer的一篇文献,大家可以去参考。标准的组织抽核方法包括;1.液氮研磨(或者组织匀浆)2.lysisbuffer孵育5-10min3.滤网过滤4.纯化。需要注意的是抽核方法在不同文献大同小异,区别不是很大,区别最大的是纯核这一步:蔗糖纯化;蔗糖密度梯度离心;碘克沙醇密度梯度离心;ficall纯化;percoll纯化;流式分选。目前用的最多效果最好的自然还是流式分选,其次是蔗糖纯化(虽然简单,便宜,但是我个人测试效果还是非常好的)。悄悄的告诉大家,现在单细胞测序已经可以适用于甲醛,乙醇交联的样本了,如果您那边抽核做的不好可以用甲醛交联一下。

为了更好的抽提纯化冻存样本的细胞核,我们精心研发了整个实验流程,不但提供相应服务,也推出了试剂盒,当然也提供后续的详细实验指导,欢迎各位老师来合作。

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